服务介绍

细菌完成图是指不需要任何现有序列信息,通过长读长测序以及生物信息学分析手段对得到的细菌物种的完整基因组及质粒序列。相比传统基于二代测序的框架图,细菌完成图可以更加准确、全面的描述细菌基因组的实际组成情况,对于基因功能研究、进化分析、工程菌改造、诊断试剂开发等有着显著价值。康为世纪基于前沿的纳米孔测序技术和完善的分析流程,可以在一周之内精准交付完整细菌基因组及质粒序列,远快于目前市面上的常规交付周期。基于自研的提取及建库试剂,客户可以以极高的性价比得到高质量的结果。

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服务特色

极速周期

基因组DNA到组装结果仅需要一周,满足您对实验进度的迫切需求

品质保证

成熟的测序及自动化分析流程,保证组装成完整的一条染色体及质粒
(1 contig, 0 gap)

高性价比

使用康为自研的提取及建库试剂,提供高质量结果的同时有效降低成本

纳米孔测序技术

纳米孔测序是一种区别于传统Sanger测序的创新测序技术,能够实现更快、更准、更便捷的测序方法。其工作原理是将DNA的一条链通过纳米级的小孔,根据实时监测并记录核酸链通过纳米孔的电流变化图谱,直接将不同碱基产生的特征性电流信号识别成对应的碱基,以此实现核酸序列的读取,无需PCR即能快速读取出长达上百万个碱基的读长数据。

随着测序质量的提高,基于超长读长及超快的测序速度的特点,纳米孔测序在细菌基因组组装领域显示出了绝对优势。

细菌完成图服务

服务项目 样本类型 交付周期(自然日)
细菌基因组DNA提取 细菌菌体 3-5
16S污染鉴定 细菌基因组DNA 2
ONT细菌完成图 细菌基因组DNA 5
*提取及16S鉴定周期单独计算

样本要求:

1.基因组DNA

DNA样品澄清透明,总量≥2 μg;DNA纯度OD260/280在1.8-2.0之间,OD260/OD230在2.0-2.2之间;DNA浓度≥50 ng/μL;DNA完整无降解,无RNA、蛋白质等污染,干冰运输。

2.菌体

菌体液体培养至对数期,OD600约0.6-0.8,收集菌体5ml,1.5ml离心管低温4度离心,弃上清,保留管底菌体,液氮冷冻,干冰运输。建议同时送一管重复。

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